118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1966 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  100 
 
 		 380 aa  779    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  74.21 
 
 		 380 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  63.16 
 
 		 380 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  63.16 
 
 		 380 aa  509  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  29.84 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  30.03 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  35.33 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  27.6 
 
 		 373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  33.69 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  33.52 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  33.88 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  28.32 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  32.32 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  34.78 
 
 		 164 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  24.6 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  30.67 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  32.32 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  30.1 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  24.67 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  31.1 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  30.73 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  33.67 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  23.65 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  23.04 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  26.94 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  25.31 
 
 		 338 aa  57  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  26.29 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  27.23 
 
 		 506 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  26.14 
 
 		 229 aa  54.7  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  27.91 
 
 		 501 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 502 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  27.07 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  30.24 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  25.88 
 
 		 496 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1210  DNA repair protein RadA  32.22 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.651562  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  26.7 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  27.07 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  25.68 
 
 		 508 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  29.38 
 
 		 161 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  26.98 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 		 507 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  26.6 
 
 		 502 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  27.04 
 
 		 484 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  26.06 
 
 		 550 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  28.33 
 
 		 563 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  25.77 
 
 		 499 aa  50.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  27.54 
 
 		 496 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 489 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  25 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  31.11 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  28.04 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  26.52 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  25.91 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  22.92 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  26.92 
 
 		 498 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  26.78 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  28.17 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1787  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  27.23 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  28.18 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  24.39 
 
 		 567 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 		 497 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0336  DNA repair protein RadA  27.66 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  27.98 
 
 		 494 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  26.56 
 
 		 236 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  26.6 
 
 		 501 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  27.96 
 
 		 448 aa  47  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 		 504 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  28.89 
 
 		 452 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  24.59 
 
 		 569 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  22.34 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  32.56 
 
 		 245 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  25.13 
 
 		 573 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  40.23 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  40.23 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  40.23 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  40.23 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  40.23 
 
 		 245 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  25.12 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  23.83 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  26.88 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  24.6 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  39.29 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  39.29 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  23.4 
 
 		 512 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  27.72 
 
 		 225 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  27.22 
 
 		 562 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  39.29 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  31.96 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1732  DNA repair protein RadA  27.1 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794111 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  39.29 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  39.29 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  23.95 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  39.29 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  39.29 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  28.89 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  39.29 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  26.47 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  39.29 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>