More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4906 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  100 
 
 		 245 aa  510  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  99.59 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  99.59 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  99.59 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  99.59 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  99.59 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  99.59 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  99.59 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  99.59 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  93.47 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  93.47 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  93.47 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  93.47 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  92.65 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  86.94 
 
 		 245 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  50.21 
 
 		 248 aa  258  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  50 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  48.77 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  48.77 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  48.77 
 
 		 249 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  48.15 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  48.76 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  47.33 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  38.59 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  36.51 
 
 		 284 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  37.04 
 
 		 286 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  36.51 
 
 		 284 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  36.72 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  35.52 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  31.4 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  35.59 
 
 		 234 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  33.51 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  28.18 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  30.66 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  30.66 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  30.66 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  30.66 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  31.51 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  30.81 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  30.81 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  29.84 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  29.88 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  27.23 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  29.19 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  27.81 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  28.17 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  24.5 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  29.37 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  26.92 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  28.57 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  25.44 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  27.46 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  28.23 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  24.34 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  32.93 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  24.55 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  32.93 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  24.55 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  29.71 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  29.71 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  29.05 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  30.22 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  27.27 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  30.46 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  26.06 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  24.11 
 
 		 276 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  24.11 
 
 		 276 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  27.86 
 
 		 327 aa  62  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  28.06 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  25 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  25 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  25 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  25.68 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  25.79 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  24.38 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  24.41 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  28.77 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  30.94 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1242  replicative DNA helicase loader DnaI  22.49 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  29.5 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  30.06 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  24.03 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  29.5 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  25 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  25.9 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  25.16 
 
 		 312 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  28.28 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1191  IstB domain protein ATP-binding protein  28.28 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>