81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1401 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  100 
 
 
360 aa  719    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  76.94 
 
 
378 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  59.62 
 
 
362 aa  432  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1787  hypothetical protein  89.04 
 
 
226 aa  404  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  55.24 
 
 
373 aa  373  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  93.81 
 
 
143 aa  194  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  27.87 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  30.88 
 
 
380 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  30.16 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  29.84 
 
 
380 aa  126  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  26.94 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  32.07 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  31.18 
 
 
326 aa  75.9  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  25.55 
 
 
345 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  26.25 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  30.22 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  27.51 
 
 
357 aa  59.3  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  30.15 
 
 
479 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  28.99 
 
 
563 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  33.95 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  30.34 
 
 
496 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  28.14 
 
 
481 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  24.39 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  25.56 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  28.78 
 
 
574 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  27.74 
 
 
488 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 
498 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  27.4 
 
 
584 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
481 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
481 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  29.58 
 
 
161 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
481 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 
463 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  30.05 
 
 
518 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  26.49 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  27.82 
 
 
504 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  26.14 
 
 
512 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  25.51 
 
 
500 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  23.61 
 
 
164 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  26.54 
 
 
510 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  26.28 
 
 
570 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  26.54 
 
 
510 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  25.64 
 
 
509 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  27.45 
 
 
565 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  26.42 
 
 
498 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  25.68 
 
 
482 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  28 
 
 
562 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  24.47 
 
 
509 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  26.35 
 
 
570 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  24.58 
 
 
474 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  24.45 
 
 
505 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  24.53 
 
 
519 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  25.57 
 
 
453 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  25.91 
 
 
528 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  26.14 
 
 
512 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  26.04 
 
 
509 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  25.57 
 
 
453 aa  46.2  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  24.44 
 
 
574 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  26.32 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  27.07 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  26.55 
 
 
521 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  26.55 
 
 
521 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  26.18 
 
 
520 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  26.52 
 
 
500 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  28.95 
 
 
231 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  35.83 
 
 
343 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  24.42 
 
 
507 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  35.83 
 
 
343 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  24.42 
 
 
507 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  35.83 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
497 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 
551 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  25.09 
 
 
484 aa  43.5  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  33.01 
 
 
379 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  25.48 
 
 
509 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  25.1 
 
 
492 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  26.89 
 
 
559 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  25.57 
 
 
512 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3827  protein RecA  35.83 
 
 
208 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3539  recA protein (recombinase A), N-terminal region  35.83 
 
 
208 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
489 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>