More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCZK3539 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3792  RecA protein  99.52 
 
 
208 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000169081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3521  recA protein (recombinase A), N-terminal region  99.52 
 
 
208 aa  411  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000289981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3539  recA protein (recombinase A), N-terminal region  100 
 
 
208 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3827  protein RecA  100 
 
 
208 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  100 
 
 
343 aa  403  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  98.52 
 
 
343 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  99.51 
 
 
343 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  99.51 
 
 
343 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  99.01 
 
 
343 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  97.04 
 
 
343 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  83.25 
 
 
355 aa  348  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  77.45 
 
 
362 aa  337  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  78.22 
 
 
364 aa  334  7e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  80.2 
 
 
347 aa  332  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  80.2 
 
 
347 aa  332  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  75.62 
 
 
364 aa  328  4e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  76.62 
 
 
379 aa  327  7e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  76.62 
 
 
379 aa  327  9e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  75.37 
 
 
349 aa  324  6e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  75.74 
 
 
376 aa  322  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  73.89 
 
 
347 aa  321  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  74.13 
 
 
352 aa  321  5e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  74.13 
 
 
352 aa  321  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  75.86 
 
 
341 aa  321  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  74.63 
 
 
343 aa  320  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  76.85 
 
 
346 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  76.5 
 
 
385 aa  320  9.999999999999999e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  75 
 
 
348 aa  318  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  72.41 
 
 
365 aa  317  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  75.49 
 
 
346 aa  317  7.999999999999999e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  79.7 
 
 
349 aa  317  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  74.26 
 
 
357 aa  316  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  75 
 
 
345 aa  315  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  75.25 
 
 
387 aa  312  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  73.13 
 
 
350 aa  311  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  72.28 
 
 
347 aa  311  4.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  72.64 
 
 
350 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  71.29 
 
 
360 aa  310  9e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  72.14 
 
 
347 aa  310  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  71.78 
 
 
366 aa  310  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3294  recA protein  73.13 
 
 
729 aa  309  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.088639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  73.63 
 
 
349 aa  309  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  72.64 
 
 
378 aa  308  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12750  DNA recombination protein RecA  71.64 
 
 
790 aa  308  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000250397  normal  0.0414269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  71.29 
 
 
366 aa  308  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  72.14 
 
 
356 aa  308  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  72.64 
 
 
347 aa  308  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  72.77 
 
 
376 aa  308  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  72.64 
 
 
350 aa  308  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  72.28 
 
 
359 aa  308  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  71.64 
 
 
344 aa  308  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  71.64 
 
 
364 aa  308  4e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  71.92 
 
 
348 aa  308  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  71.92 
 
 
348 aa  308  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  71.14 
 
 
357 aa  308  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  71.29 
 
 
383 aa  308  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  72.14 
 
 
350 aa  308  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  69.31 
 
 
343 aa  307  6.999999999999999e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  72.06 
 
 
344 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  72.64 
 
 
346 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  71.78 
 
 
347 aa  306  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  73.13 
 
 
368 aa  306  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  69.95 
 
 
351 aa  306  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  71 
 
 
418 aa  305  2.0000000000000002e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  71.64 
 
 
351 aa  305  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  70.15 
 
 
390 aa  305  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  72.14 
 
 
345 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  67.66 
 
 
346 aa  305  3e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  72.14 
 
 
347 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  72.14 
 
 
347 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  72.14 
 
 
347 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  71.14 
 
 
345 aa  304  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  72.77 
 
 
341 aa  304  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  74.13 
 
 
345 aa  304  7e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0858  recA protein  71.64 
 
 
349 aa  304  7e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.873565  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  68.32 
 
 
348 aa  303  8.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3919  recA protein  71.14 
 
 
344 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  69.65 
 
 
348 aa  302  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  71.78 
 
 
362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  69.65 
 
 
350 aa  302  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  72.5 
 
 
344 aa  302  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  72.64 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  71.08 
 
 
336 aa  301  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  69.8 
 
 
367 aa  302  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  70.65 
 
 
345 aa  301  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  69.5 
 
 
379 aa  301  4.0000000000000003e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  72.14 
 
 
347 aa  301  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  71.78 
 
 
358 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  69.8 
 
 
348 aa  301  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  69.8 
 
 
348 aa  300  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  70.65 
 
 
354 aa  300  7.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  69.15 
 
 
348 aa  301  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  73.04 
 
 
333 aa  300  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  69.65 
 
 
347 aa  300  7.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  70.79 
 
 
343 aa  300  9e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  70.65 
 
 
352 aa  300  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  71.14 
 
 
352 aa  300  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  73.63 
 
 
379 aa  300  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  72 
 
 
338 aa  299  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  72 
 
 
338 aa  299  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>