More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5903 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  100 
 
 		 379 aa  763    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  75.38 
 
 		 341 aa  525  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  75.08 
 
 		 358 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  73.41 
 
 		 358 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  73.72 
 
 		 358 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  73.41 
 
 		 358 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  71.56 
 
 		 336 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  70.41 
 
 		 338 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  71.65 
 
 		 338 aa  502  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  72.46 
 
 		 350 aa  500  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  75 
 
 		 339 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  70.59 
 
 		 357 aa  499  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  75 
 
 		 359 aa  498  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  74.03 
 
 		 338 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  70.09 
 
 		 357 aa  494  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  71.65 
 
 		 355 aa  494  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  72.31 
 
 		 363 aa  492  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  73.6 
 
 		 357 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  72.1 
 
 		 348 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  72.1 
 
 		 348 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  72.87 
 
 		 340 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  72.5 
 
 		 343 aa  488  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  70.15 
 
 		 362 aa  484  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  70.15 
 
 		 362 aa  485  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  71.69 
 
 		 343 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  71.69 
 
 		 366 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  68.19 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  67.53 
 
 		 358 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  67.15 
 
 		 363 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  70.82 
 
 		 358 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  71.69 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  73.83 
 
 		 365 aa  487  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  68.75 
 
 		 343 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  66.95 
 
 		 390 aa  485  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  69.58 
 
 		 356 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  67.52 
 
 		 362 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  69.97 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  69.97 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  73.68 
 
 		 333 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  68.88 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  69.97 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  70.46 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  69.97 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  71.91 
 
 		 342 aa  481  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  69.88 
 
 		 348 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  71.69 
 
 		 347 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  69.88 
 
 		 356 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  69.67 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  66.01 
 
 		 364 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  72.98 
 
 		 356 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  70.99 
 
 		 348 aa  481  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  70.43 
 
 		 358 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  68.88 
 
 		 361 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  70.15 
 
 		 363 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  69.85 
 
 		 362 aa  481  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  67.54 
 
 		 364 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  69.88 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  68.88 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  70.59 
 
 		 360 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  72.36 
 
 		 345 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  66.57 
 
 		 363 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  69.37 
 
 		 359 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  69.97 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  69.37 
 
 		 359 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  72.36 
 
 		 345 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  69.88 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  71.65 
 
 		 352 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  69.97 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  67.84 
 
 		 350 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  69.97 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  69.58 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  70.34 
 
 		 359 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  65.71 
 
 		 347 aa  480  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  71.47 
 
 		 360 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  68.14 
 
 		 358 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  67.67 
 
 		 361 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  70.73 
 
 		 345 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  73.08 
 
 		 347 aa  474  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  69.12 
 
 		 350 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  66.95 
 
 		 351 aa  475  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  70.86 
 
 		 345 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  72.62 
 
 		 345 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  70.77 
 
 		 350 aa  475  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  70.72 
 
 		 348 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  66.47 
 
 		 364 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  70.95 
 
 		 368 aa  475  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  71.21 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  68.84 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  68.28 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  67.89 
 
 		 341 aa  471  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  69.23 
 
 		 366 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  71.43 
 
 		 343 aa  474  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  68.62 
 
 		 347 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  66.97 
 
 		 351 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  69.76 
 
 		 345 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  69.33 
 
 		 377 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  68.1 
 
 		 347 aa  471  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  71.43 
 
 		 343 aa  474  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  66.77 
 
 		 365 aa  473  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  70.43 
 
 		 347 aa  471  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>