More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0880 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  66.67 
 
 		 446 aa  635    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 450 aa  915    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  66.89 
 
 		 446 aa  637    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  66.67 
 
 		 446 aa  635    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  66.44 
 
 		 446 aa  631  1e-180  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  66.44 
 
 		 446 aa  634  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  66 
 
 		 446 aa  633  1e-180  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  67.26 
 
 		 448 aa  622  1e-177  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1210  DNA repair protein RadA  67.33 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.651562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  62.64 
 
 		 447 aa  588  1e-167  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  49.06 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  49.06 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 		 484 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  49.3 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  45.15 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  47.32 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  51.4 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  46.68 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  44.72 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  46.12 
 
 		 448 aa  415  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  47.92 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  45.9 
 
 		 448 aa  408  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  44.77 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  45.95 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  46.14 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  47.25 
 
 		 452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  46.35 
 
 		 449 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  44.79 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  45.25 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  48.49 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  45.13 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  48.71 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  43.96 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  47.22 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  45.03 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  45.94 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  44.25 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  45.94 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  45.94 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  45.94 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  46.17 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  44.71 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  45.94 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  44.71 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  45.94 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  43.9 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  47.48 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  47.25 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  45.94 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  48.14 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  44.37 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  44.37 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  45.71 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  45.51 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  44.37 
 
 		 456 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  45.71 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  45.56 
 
 		 465 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  46.79 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  44.82 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  44.82 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  45.06 
 
 		 451 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  44.42 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  47.36 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  46.34 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  45.24 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  45.77 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  46.37 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  44.21 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  43.15 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  45.5 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  44.14 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0305  DNA repair protein RadA  45.11 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  44.65 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  46.12 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  44.05 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  42.89 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  47.41 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  41.72 
 
 		 518 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  42.48 
 
 		 457 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  45.77 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  45.35 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  44.93 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  45.47 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  42.76 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  43.62 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  43.24 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  44.39 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0314  DNA repair protein RadA  45.27 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  42.73 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  43.17 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4932  DNA repair protein RadA  45.83 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  47.09 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>