More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1212 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1212  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 449 aa  879    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.563327  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  61 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1656  DNA repair protein RadA  58.39 
 
 		 438 aa  462  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353254  normal  0.473589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  49.23 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  46.85 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  47.28 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  46.3 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  46.3 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  46.3 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  46.3 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 458 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  46.3 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  46.3 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  45.92 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  46.06 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  48.74 
 
 		 484 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  46.76 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  45.71 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  49.23 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  45.71 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.89 
 
 		 457 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  48.87 
 
 		 462 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  45.73 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 451 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  47.25 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  46.84 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  46.78 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  47.26 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  46.55 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  46.09 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  45.56 
 
 		 482 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  47.05 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  44.57 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  44.84 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  43.48 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  46.94 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0180  DNA repair protein RadA  50.69 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  45.22 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  48.17 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  48.96 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  48.65 
 
 		 481 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  48.19 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  47.24 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  48.96 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0199  DNA repair protein RadA  50.69 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  47.69 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  48.67 
 
 		 457 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  47.96 
 
 		 456 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  49.65 
 
 		 462 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  45.73 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0314  DNA repair protein RadA  50.46 
 
 		 476 aa  363  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  47.18 
 
 		 463 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  47.56 
 
 		 460 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  47.18 
 
 		 463 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  48.39 
 
 		 455 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1712  DNA repair protein RadA  47.93 
 
 		 455 aa  362  8e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.136365  normal  0.743682 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  45.48 
 
 		 454 aa  361  1e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  48.39 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  48.42 
 
 		 476 aa  361  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 		 453 aa  361  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  43.23 
 
 		 453 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  48.39 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  47.1 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4989  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.541639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  48.51 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  47.1 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  48.28 
 
 		 455 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  43.45 
 
 		 453 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  47.32 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  44.5 
 
 		 457 aa  360  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  48.42 
 
 		 476 aa  360  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  47.71 
 
 		 453 aa  360  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0839  DNA repair protein RadA  45.81 
 
 		 458 aa  358  8e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0667  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  45.67 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2252  DNA repair protein RadA  47.76 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  44.37 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  48.05 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  48.05 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  46.73 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>