More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1656 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1656  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 438 aa  857    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353254  normal  0.473589 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  75.34 
 
 		 434 aa  618  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1212  DNA repair protein RadA  58.33 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.563327  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  45.41 
 
 		 458 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  46.51 
 
 		 452 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  44.72 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  44.72 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  44.72 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  44.72 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  44.95 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  44.95 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  44.72 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  44.72 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  44.95 
 
 		 458 aa  382  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  45.27 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  47.63 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  43.86 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  48.16 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  44.16 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  44.5 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  48.82 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  46.28 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  43.94 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  45.56 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  48.13 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  44.85 
 
 		 484 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  44.21 
 
 		 454 aa  363  4e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  45.5 
 
 		 452 aa  363  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  41.65 
 
 		 457 aa  362  6e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  44.34 
 
 		 476 aa  362  7.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 		 451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  40.63 
 
 		 457 aa  362  9e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  47.48 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  43.25 
 
 		 457 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  43.98 
 
 		 453 aa  356  3.9999999999999996e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 465 aa  356  5e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  47.49 
 
 		 453 aa  356  5e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  40.99 
 
 		 507 aa  354  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  46.56 
 
 		 474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  45.75 
 
 		 462 aa  353  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  45.58 
 
 		 449 aa  352  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  47.2 
 
 		 460 aa  352  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  45.73 
 
 		 450 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  47.64 
 
 		 463 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  43.49 
 
 		 451 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  41.86 
 
 		 454 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  41.86 
 
 		 454 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  45.26 
 
 		 453 aa  350  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  45.01 
 
 		 467 aa  349  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  42.33 
 
 		 457 aa  349  6e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  41.86 
 
 		 451 aa  349  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  46.48 
 
 		 447 aa  348  8e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  46.45 
 
 		 455 aa  348  8e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  47.81 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  38.7 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  45.37 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  48.7 
 
 		 445 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  40.23 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  46.12 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  44.11 
 
 		 466 aa  345  6e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  44.68 
 
 		 453 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2597  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 		 477 aa  345  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  45.84 
 
 		 464 aa  345  8e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  44.68 
 
 		 453 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  44.35 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  43.65 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  44.35 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  44.02 
 
 		 458 aa  344  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  40.95 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  45.27 
 
 		 452 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  45.84 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  44.65 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1712  DNA repair protein RadA  46.76 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.136365  normal  0.743682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  44.68 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  45.61 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  40.88 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  41.61 
 
 		 520 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  44.42 
 
 		 455 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  44.65 
 
 		 455 aa  343  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  43.49 
 
 		 451 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4631  DNA repair protein RadA  45.96 
 
 		 477 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.742671  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  43.49 
 
 		 451 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  40.28 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  44.68 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  39.63 
 
 		 446 aa  340  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  42.33 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  39.67 
 
 		 518 aa  339  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  45.61 
 
 		 449 aa  339  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 466 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  46.42 
 
 		 478 aa  339  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 466 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  44.88 
 
 		 466 aa  338  8e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2284  DNA repair protein RadA  45.71 
 
 		 503 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  40.17 
 
 		 514 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  40.17 
 
 		 514 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  41.84 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  41.9 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  41.4 
 
 		 459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>