More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56161 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_56161  predicted protein  100 
 
 		 478 aa  970    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  39.25 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 442 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  36.46 
 
 		 434 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  37.18 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  33.82 
 
 		 442 aa  260  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 451 aa  259  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 444 aa  257  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  35.89 
 
 		 437 aa  256  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  34.46 
 
 		 489 aa  256  9e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06522  mitochondrial GTPase (Mss1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04950)  34.17 
 
 		 614 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.240099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  35.36 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  36.33 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  35.14 
 
 		 437 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  34.45 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  34.99 
 
 		 435 aa  247  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 456 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  33.2 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  35.38 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  37.29 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  32.51 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0032  tRNA modification GTPase TrmE  34.38 
 
 		 441 aa  240  5e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  35.68 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0981  tRNA modification GTPase TrmE  40.95 
 
 		 508 aa  238  1e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  33.4 
 
 		 440 aa  236  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  33.82 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  32.58 
 
 		 429 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  34.16 
 
 		 460 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  33.82 
 
 		 437 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.910878 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  33.96 
 
 		 445 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  35.26 
 
 		 460 aa  226  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  33.61 
 
 		 460 aa  223  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0010  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 		 435 aa  223  6e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  33.67 
 
 		 462 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  32.78 
 
 		 428 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  33.2 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  33.26 
 
 		 441 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  32.78 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  33.47 
 
 		 428 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  34.03 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0137  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 437 aa  219  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  34.57 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  34.57 
 
 		 452 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  32.51 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  32.85 
 
 		 450 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  32.44 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  34.85 
 
 		 487 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  38.19 
 
 		 550 aa  213  7e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2143  tRNA modification GTPase TrmE  34.02 
 
 		 478 aa  209  7e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0104732  hitchhiker  0.000152188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  32.79 
 
 		 454 aa  209  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  32.44 
 
 		 461 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  32.24 
 
 		 464 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  32.11 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  33.4 
 
 		 455 aa  207  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  33.2 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1231  tRNA modification GTPase TrmE  33.61 
 
 		 469 aa  206  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.0000000119996  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  32.86 
 
 		 473 aa  206  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 456 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  33.81 
 
 		 441 aa  206  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  30.66 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  30.64 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  32.85 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2853  tRNA modification GTPase TrmE  33.12 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0789426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  33.13 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  30.82 
 
 		 455 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  31.07 
 
 		 458 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  30.48 
 
 		 446 aa  202  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  31.25 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  41.1 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  33.06 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  32.37 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  32.44 
 
 		 456 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  31.84 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  33.26 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  30.97 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  31.33 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  33.12 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2599  tRNA modification GTPase TrmE  31.4 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.157289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  32.44 
 
 		 456 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  33.06 
 
 		 455 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  32.71 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  31.48 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  32.92 
 
 		 454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  31.16 
 
 		 456 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  32.92 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  32.66 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2387  tRNA modification GTPase TrmE  33.47 
 
 		 465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.188748  hitchhiker  0.000106684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  32.71 
 
 		 455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  32.99 
 
 		 455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  31.85 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  31.82 
 
 		 465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  32.5 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  32.85 
 
 		 456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  32.58 
 
 		 456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  30.96 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  32.02 
 
 		 456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>