More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2964 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 
438 aa  855    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  51.6 
 
 
435 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  52.55 
 
 
438 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  50.99 
 
 
447 aa  364  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  50 
 
 
444 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  50.11 
 
 
437 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  49.89 
 
 
431 aa  346  5e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  50 
 
 
434 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  48.74 
 
 
451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  44.42 
 
 
442 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  47.63 
 
 
448 aa  339  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  49.24 
 
 
455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  46 
 
 
442 aa  336  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  46 
 
 
442 aa  336  5.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  51.03 
 
 
444 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  45.83 
 
 
456 aa  335  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  45.23 
 
 
436 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  50.68 
 
 
444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  47.62 
 
 
428 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  41.48 
 
 
439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  46.44 
 
 
429 aa  324  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0032  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 
441 aa  322  8e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  44.65 
 
 
428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  48.53 
 
 
441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  46.14 
 
 
428 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  45.52 
 
 
437 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  46.78 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  45.89 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  45.79 
 
 
437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.910878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  45.7 
 
 
440 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  45.68 
 
 
428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  45.83 
 
 
457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  44.49 
 
 
462 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  43.97 
 
 
449 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  44.7 
 
 
441 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  46.67 
 
 
433 aa  296  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  43.84 
 
 
460 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_002978  WD0981  tRNA modification GTPase TrmE  48.99 
 
 
508 aa  291  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0010  tRNA modification GTPase TrmE  41.88 
 
 
435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000341639  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0003  tRNA modification GTPase TrmE  45.87 
 
 
419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  41.98 
 
 
454 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 
446 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  41.48 
 
 
454 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  41.48 
 
 
454 aa  279  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  41.48 
 
 
454 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  41.83 
 
 
454 aa  279  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 
446 aa  278  9e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  39.2 
 
 
452 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  41.48 
 
 
454 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  39.2 
 
 
473 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  41.27 
 
 
454 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  41.27 
 
 
454 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  41.27 
 
 
454 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  41.27 
 
 
454 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  41.27 
 
 
454 aa  276  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  41.15 
 
 
453 aa  274  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  41.01 
 
 
454 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  40.79 
 
 
467 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  40.79 
 
 
467 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  40.79 
 
 
467 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  40.79 
 
 
454 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  40.79 
 
 
454 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  40.79 
 
 
454 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  40.75 
 
 
454 aa  269  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  40.75 
 
 
454 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  40.4 
 
 
454 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  39.18 
 
 
448 aa  266  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  40.35 
 
 
454 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  38.13 
 
 
456 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  38.67 
 
 
475 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56161  predicted protein  36.76 
 
 
478 aa  263  4.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  39.51 
 
 
458 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  46.03 
 
 
550 aa  263  4.999999999999999e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  41.57 
 
 
446 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  39.1 
 
 
489 aa  262  8e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  38.94 
 
 
452 aa  261  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  40.32 
 
 
449 aa  259  9e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  38.29 
 
 
457 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  38.14 
 
 
459 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0137  tRNA modification GTPase TrmE  41.85 
 
 
437 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 
458 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  38.41 
 
 
453 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  38.86 
 
 
462 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  38.41 
 
 
453 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0199  tRNA modification GTPase TrmE  41.69 
 
 
426 aa  255  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  39.65 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  38.41 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 
455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  38.16 
 
 
453 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4379  tRNA modification GTPase TrmE  38.16 
 
 
479 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000434128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  38.16 
 
 
453 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1231  tRNA modification GTPase TrmE  43.84 
 
 
469 aa  252  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.0000000119996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  38.16 
 
 
453 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  39.51 
 
 
456 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  39.25 
 
 
455 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4256  tRNA modification GTPase TrmE  38.41 
 
 
453 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 
456 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  38.16 
 
 
453 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  37.75 
 
 
453 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2881  tRNA modification GTPase TrmE  41.23 
 
 
444 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470737  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>