More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0010 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0010  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 435 aa  885    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000341639  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  54.38 
 
 		 442 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  53.23 
 
 		 442 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  53.23 
 
 		 442 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  48.28 
 
 		 442 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  48.74 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  47.86 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  46.77 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  47 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.910878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  43.08 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  42.01 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  43.96 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  41.86 
 
 		 451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  40.45 
 
 		 448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  40.75 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  41.48 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  42.6 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  41.76 
 
 		 445 aa  295  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  40.5 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  40.58 
 
 		 449 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  41.31 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  41.88 
 
 		 438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  41.63 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  41.01 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  41.63 
 
 		 447 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  40.5 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  37.36 
 
 		 456 aa  276  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  40.45 
 
 		 444 aa  276  7e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  39.37 
 
 		 444 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  37.06 
 
 		 489 aa  270  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  38.77 
 
 		 457 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  39.73 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 444 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  40.36 
 
 		 437 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  40.87 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  39.09 
 
 		 433 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  34.81 
 
 		 475 aa  263  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  40.87 
 
 		 428 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  37.22 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  39 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  36.18 
 
 		 453 aa  261  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  34.88 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  35.9 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  35.32 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0137  tRNA modification GTPase TrmE  37.33 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  37.56 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  36.2 
 
 		 453 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  35.38 
 
 		 456 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  36.48 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 		 454 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  36.53 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  35.89 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  36.48 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  35.32 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  35.6 
 
 		 454 aa  250  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  35.1 
 
 		 464 aa  250  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 453 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  34.44 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  35.1 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  35.38 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  35.89 
 
 		 454 aa  247  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  35.54 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2881  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 467 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 467 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 454 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 467 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  35.54 
 
 		 453 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 454 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  34.65 
 
 		 453 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  35.24 
 
 		 453 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0199  tRNA modification GTPase TrmE  36.9 
 
 		 426 aa  246  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  34.65 
 
 		 453 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  35.23 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  36.53 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  35.16 
 
 		 453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 454 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4379  tRNA modification GTPase TrmE  35.02 
 
 		 479 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000434128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 454 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 454 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 456 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 456 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 		 446 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  35.75 
 
 		 455 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  34.9 
 
 		 471 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  35.98 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  34.96 
 
 		 473 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  35.9 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  34.96 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>