More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0060 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0032  tRNA modification GTPase TrmE  86.33 
 
 		 441 aa  797    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 439 aa  897    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0981  tRNA modification GTPase TrmE  48.71 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  41.48 
 
 		 438 aa  326  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  41.61 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  52.04 
 
 		 550 aa  300  3e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 444 aa  299  9e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  39.86 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  37.89 
 
 		 451 aa  296  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  37.95 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  37.83 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  38.43 
 
 		 431 aa  289  9e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  37.14 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  37.81 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  38.75 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 		 449 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  36.55 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  38.21 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  38.16 
 
 		 446 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  38.13 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  38.43 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  38.26 
 
 		 436 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  39.07 
 
 		 445 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  39.56 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 457 aa  276  7e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  38.46 
 
 		 456 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  38.75 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  38.75 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  39.33 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 460 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  38.02 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  37.2 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  37.2 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  37.56 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  37.2 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  39.1 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 454 aa  269  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  38.58 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  36.56 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  36.56 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 454 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 454 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 454 aa  265  8.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 454 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4904  tRNA modification GTPase TrmE  34.44 
 
 		 478 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  36 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  35.46 
 
 		 454 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  35.89 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  35.89 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  35.89 
 
 		 467 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  35.89 
 
 		 467 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  35.89 
 
 		 467 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  36.2 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  35.24 
 
 		 454 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  37.02 
 
 		 462 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  36.52 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  34.71 
 
 		 475 aa  256  5e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  35.98 
 
 		 456 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  34.73 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  36.18 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  35.38 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  35.38 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  35.54 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  35.98 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4112  tRNA modification GTPase TrmE  34.17 
 
 		 478 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.712648  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  34.68 
 
 		 456 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  35.68 
 
 		 428 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  35.38 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  35.98 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  36.18 
 
 		 453 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  35.51 
 
 		 453 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  36.4 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0003  tRNA modification GTPase TrmE  37.98 
 
 		 419 aa  250  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  37 
 
 		 455 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 469 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  35.32 
 
 		 447 aa  249  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  36.28 
 
 		 453 aa  249  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  35.08 
 
 		 453 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  34.86 
 
 		 453 aa  249  9e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  35.51 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56161  predicted protein  34.45 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  33.96 
 
 		 471 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  34.93 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  35.53 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  35.54 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 458 aa  246  4e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  35.12 
 
 		 446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>