More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2062 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 442 aa  896    Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  99.55 
 
 		 442 aa  889    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  81.67 
 
 		 442 aa  734    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0010  tRNA modification GTPase TrmE  53.23 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000341639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  54.13 
 
 		 442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  52.64 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  52.64 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.910878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  51.26 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  51.69 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  47.8 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  46.74 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  49.08 
 
 		 431 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  47.23 
 
 		 449 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  45.51 
 
 		 462 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  45.75 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  48.21 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  47.42 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  45.54 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  46 
 
 		 438 aa  336  5e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  46.82 
 
 		 434 aa  335  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  46.59 
 
 		 457 aa  335  9e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  47.17 
 
 		 441 aa  326  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  45.51 
 
 		 460 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  44.29 
 
 		 441 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  45.79 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  46.71 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  47.19 
 
 		 428 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  45.43 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  44.29 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  46.74 
 
 		 428 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  42.56 
 
 		 429 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  45.85 
 
 		 455 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  46.03 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  45.06 
 
 		 433 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  42.86 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  40.08 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0137  tRNA modification GTPase TrmE  41.78 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  42.32 
 
 		 447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  41.65 
 
 		 448 aa  279  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  38.13 
 
 		 454 aa  276  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4138  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 		 486 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619376  normal  0.415942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  39.33 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  38.13 
 
 		 454 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  38.13 
 
 		 454 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  38.13 
 
 		 454 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 481 aa  272  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 453 aa  272  9e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  38.26 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4791  tRNA modification GTPase TrmE  38.96 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0003  tRNA modification GTPase TrmE  42.05 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  39.13 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3495  tRNA modification GTPase TrmE  38.49 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  38.05 
 
 		 453 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  38.05 
 
 		 457 aa  270  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 		 467 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 		 467 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 		 467 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  37.91 
 
 		 454 aa  269  7e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  39.12 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  38.05 
 
 		 453 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  36.9 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  38.7 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  38.05 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  37.2 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  37.83 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4379  tRNA modification GTPase TrmE  38.05 
 
 		 479 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000434128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  38.7 
 
 		 455 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56161  predicted protein  35.28 
 
 		 478 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0032  tRNA modification GTPase TrmE  38.08 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  39.69 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  37.14 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  36.96 
 
 		 454 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  36.96 
 
 		 454 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3774  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 		 466 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0161001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  37.89 
 
 		 453 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  36.74 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  37.83 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  36.38 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0199  tRNA modification GTPase TrmE  41.06 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  38.04 
 
 		 456 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  39.78 
 
 		 448 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  38.04 
 
 		 456 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5049  tRNA modification GTPase TrmE  35.15 
 
 		 471 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0840037  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2757  tRNA modification GTPase TrmE  38.93 
 
 		 446 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>