More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1093 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1093  BRCT domain protein  100 
 
 
600 aa  1130    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1122  BRCT domain protein  94.33 
 
 
569 aa  977    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.910902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  50 
 
 
670 aa  82.4  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  52 
 
 
684 aa  81.3  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  50 
 
 
671 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  50 
 
 
671 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  44.19 
 
 
682 aa  79  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2066  DNA ligase, NAD-dependent  43.53 
 
 
701 aa  79  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2093  DNA ligase, NAD-dependent  44.05 
 
 
705 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259807  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2876  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.77 
 
 
719 aa  77  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0956415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  44.19 
 
 
678 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.75 
 
 
774 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  40.24 
 
 
712 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  41.38 
 
 
706 aa  75.5  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  44 
 
 
672 aa  75.5  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.42 
 
 
673 aa  74.7  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  47.95 
 
 
674 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  47.95 
 
 
674 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.53 
 
 
676 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  40.45 
 
 
707 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  44.3 
 
 
662 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1762  DNA ligase, NAD-dependent  43.18 
 
 
720 aa  72.8  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654069  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  43.04 
 
 
675 aa  72  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  40.48 
 
 
666 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  40.48 
 
 
670 aa  71.2  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0729  DNA ligase, NAD-dependent  41.11 
 
 
687 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  39.56 
 
 
690 aa  71.2  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  36.11 
 
 
715 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  40.48 
 
 
673 aa  71.2  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  40.96 
 
 
673 aa  70.9  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0939  DNA ligase (NAD+)  44.59 
 
 
698 aa  70.5  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  38.55 
 
 
672 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  41.67 
 
 
670 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  44.58 
 
 
695 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  42.68 
 
 
722 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2070  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.78 
 
 
717 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2840  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.96 
 
 
718 aa  69.7  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229062  normal  0.0102416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0728  DNA ligase, NAD-dependent  41.11 
 
 
687 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  43.84 
 
 
671 aa  68.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  44.74 
 
 
673 aa  68.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.82 
 
 
679 aa  68.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  43.42 
 
 
673 aa  68.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  41.49 
 
 
920 aa  68.2  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  40.45 
 
 
726 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  42.86 
 
 
675 aa  68.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.26 
 
 
671 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.26 
 
 
671 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0693  DNA ligase, NAD-dependent  40 
 
 
687 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.600829  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  40 
 
 
684 aa  67.8  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.43 
 
 
697 aa  67.8  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.56 
 
 
671 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.26 
 
 
671 aa  67.4  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4392  BRCT domain protein  31.16 
 
 
783 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100979 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.46 
 
 
680 aa  67.4  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  35 
 
 
678 aa  67  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  41.57 
 
 
688 aa  67  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.37 
 
 
731 aa  67  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  39.13 
 
 
711 aa  67  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2579  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.87 
 
 
718 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  38.37 
 
 
775 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.26 
 
 
671 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  41.77 
 
 
691 aa  66.6  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  40.74 
 
 
718 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0706  DNA ligase, NAD-dependent  40.23 
 
 
699 aa  66.6  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948055  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  44.16 
 
 
685 aa  66.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  43.9 
 
 
673 aa  66.6  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  35.23 
 
 
681 aa  66.6  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.26 
 
 
671 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  40.26 
 
 
671 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0463  DNA ligase, NAD-dependent  41.67 
 
 
684 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2746  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.91 
 
 
786 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0339353  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0451  DNA ligase, NAD-dependent  37.23 
 
 
808 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.950618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  46.58 
 
 
732 aa  66.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.26 
 
 
671 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  38.16 
 
 
672 aa  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2841  DNA ligase, NAD-dependent  38.46 
 
 
732 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  40.26 
 
 
671 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.26 
 
 
671 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.26 
 
 
671 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.26 
 
 
671 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  39.47 
 
 
683 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  38.36 
 
 
668 aa  65.1  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.26 
 
 
738 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.96 
 
 
671 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  41.67 
 
 
678 aa  65.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3466  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 
689 aa  65.1  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184307  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  43.66 
 
 
671 aa  65.1  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3294  DNA ligase, NAD-dependent  40.96 
 
 
795 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36347  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1526  DNA ligase, NAD-dependent  35.96 
 
 
797 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0626416  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.67 
 
 
670 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1398  putative DNA ligase (polydeoxyribonucleotide synthase [NAD+]) protein  41.77 
 
 
813 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.67 
 
 
670 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.67 
 
 
670 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  39.47 
 
 
714 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2844  DNA ligase, NAD-dependent  41.98 
 
 
707 aa  64.3  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.764742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  38.71 
 
 
711 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  44.16 
 
 
749 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.74 
 
 
691 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.44 
 
 
712 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.67 
 
 
671 aa  63.9  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>