143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4392 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4392  BRCT domain protein  100 
 
 		 783 aa  1385    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1122  BRCT domain protein  31.15 
 
 		 569 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.910902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  42.86 
 
 		 682 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  29.03 
 
 		 671 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  29.03 
 
 		 671 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  47.44 
 
 		 674 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  47.22 
 
 		 674 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.76 
 
 		 774 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.05 
 
 		 680 aa  70.5  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  36.59 
 
 		 712 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  19.53 
 
 		 1036 aa  68.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.14 
 
 		 676 aa  67.8  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  43.84 
 
 		 706 aa  67.4  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  43.84 
 
 		 707 aa  67  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  37.5 
 
 		 672 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  46.58 
 
 		 662 aa  66.6  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  41.46 
 
 		 678 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1093  BRCT domain protein  32.64 
 
 		 600 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  39.73 
 
 		 678 aa  66.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1812  DNA ligase (NAD+)  43.84 
 
 		 677 aa  66.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  43.06 
 
 		 684 aa  66.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  41.98 
 
 		 662 aa  66.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  30.71 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  38.82 
 
 		 711 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  16.7 
 
 		 2228 aa  65.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  40 
 
 		 675 aa  65.1  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  41.56 
 
 		 672 aa  64.3  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  40.79 
 
 		 683 aa  64.3  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0689  NAD-dependent DNA ligase LigA  40 
 
 		 647 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2093  DNA ligase, NAD-dependent  35.44 
 
 		 705 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259807  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1066  DNA ligase, NAD-dependent  37.65 
 
 		 709 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.21 
 
 		 738 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1083  NAD-dependent DNA ligase LigA  40 
 
 		 647 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.88186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  39.73 
 
 		 672 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  38.89 
 
 		 721 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  42.47 
 
 		 690 aa  62.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0614  NAD-dependent DNA ligase LigA  40 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88532  predicted protein  22.87 
 
 		 3608 aa  62.4  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.478087 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0500  DNA ligase, NAD-dependent  30.88 
 
 		 670 aa  61.6  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.147098  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  36.99 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2876  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.8 
 
 		 719 aa  61.2  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0956415  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.89 
 
 		 697 aa  60.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  39.44 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  39.53 
 
 		 681 aa  60.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  37.66 
 
 		 671 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.73 
 
 		 679 aa  60.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  40.79 
 
 		 670 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  31.3 
 
 		 683 aa  59.7  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  36.99 
 
 		 671 aa  59.7  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2844  DNA ligase, NAD-dependent  36.11 
 
 		 707 aa  59.3  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.764742  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  32.88 
 
 		 688 aa  59.3  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  32.88 
 
 		 688 aa  59.3  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  41.1 
 
 		 704 aa  58.9  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  40 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  40 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  39.44 
 
 		 668 aa  58.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0735  DNA ligase, NAD-dependent  38.46 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  39.77 
 
 		 670 aa  58.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  45.83 
 
 		 661 aa  58.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  40 
 
 		 671 aa  58.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0693  DNA ligase, NAD-dependent  32.74 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.600829  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0947  DNA ligase, NAD-dependent  36.25 
 
 		 675 aa  57.8  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  32.48 
 
 		 715 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  40 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  40 
 
 		 668 aa  57.4  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  40.54 
 
 		 693 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.33 
 
 		 673 aa  57.4  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  32.5 
 
 		 696 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  17.71 
 
 		 1193 aa  57.4  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  20.38 
 
 		 1170 aa  57.4  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  38.36 
 
 		 673 aa  57.4  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  38.36 
 
 		 670 aa  57.4  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0728  DNA ligase, NAD-dependent  33.04 
 
 		 687 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  37.14 
 
 		 671 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  36.05 
 
 		 694 aa  56.6  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.26 
 
 		 681 aa  56.6  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  38.67 
 
 		 671 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.67 
 
 		 671 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  38.67 
 
 		 671 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  35 
 
 		 678 aa  55.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.67 
 
 		 671 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.67 
 
 		 671 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.74 
 
 		 670 aa  55.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.67 
 
 		 671 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  38.95 
 
 		 670 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.67 
 
 		 671 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  23.53 
 
 		 348 aa  55.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1850  hypothetical protein  22.46 
 
 		 451 aa  55.1  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3638  chromosome segregation ATPase-like protein  41.14 
 
 		 480 aa  55.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4244  chromosome segregation ATPase-like protein  34.91 
 
 		 287 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.164792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  40 
 
 		 673 aa  54.7  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  22.8 
 
 		 1189 aa  54.7  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  37.97 
 
 		 691 aa  54.7  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0860  hypothetical protein  23.1 
 
 		 752 aa  53.9  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.294575  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  20.65 
 
 		 915 aa  53.5  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  37.5 
 
 		 680 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0624  NAD-dependent DNA ligase  42.62 
 
 		 686 aa  52.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.182096  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  38.67 
 
 		 797 aa  53.5  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  41.1 
 
 		 677 aa  52.4  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  17.83 
 
 		 1474 aa  52  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>