More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0947 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0947  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 675 aa  1332    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  56.75 
 
 		 669 aa  745    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  46.39 
 
 		 688 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  46.39 
 
 		 688 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  47.28 
 
 		 662 aa  597  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  45.8 
 
 		 681 aa  588  1e-166  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.64 
 
 		 670 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  41.08 
 
 		 684 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  43.84 
 
 		 662 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.51 
 
 		 669 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.36 
 
 		 669 aa  559  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.36 
 
 		 669 aa  559  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.36 
 
 		 669 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.51 
 
 		 669 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.51 
 
 		 669 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  43.68 
 
 		 668 aa  558  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  41.8 
 
 		 672 aa  561  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.64 
 
 		 669 aa  561  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.36 
 
 		 669 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.51 
 
 		 669 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.55 
 
 		 670 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.21 
 
 		 669 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  44.46 
 
 		 670 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.36 
 
 		 669 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  43.19 
 
 		 663 aa  555  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  41.79 
 
 		 670 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  43.27 
 
 		 662 aa  543  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  41.19 
 
 		 670 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  41.39 
 
 		 677 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  42.73 
 
 		 673 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  40.09 
 
 		 674 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.51 
 
 		 676 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  39.78 
 
 		 673 aa  534  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  40.09 
 
 		 674 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  41.67 
 
 		 665 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  42.27 
 
 		 663 aa  525  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  41.55 
 
 		 667 aa  528  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  40.65 
 
 		 673 aa  528  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  41.55 
 
 		 667 aa  528  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  40.67 
 
 		 659 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  39.88 
 
 		 683 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  38.7 
 
 		 672 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  41.36 
 
 		 668 aa  522  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  39.29 
 
 		 678 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  40.43 
 
 		 670 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1253  DNA ligase, NAD-dependent  42.19 
 
 		 669 aa  520  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl160  DNA ligase, polydeoxyribonucleotide synthase NAD+  44.78 
 
 		 666 aa  520  1e-146  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0025564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  39.62 
 
 		 671 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  40.24 
 
 		 668 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2539  DNA ligase, NAD-dependent  40.09 
 
 		 696 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  40.42 
 
 		 668 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  39.39 
 
 		 680 aa  520  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  38.31 
 
 		 666 aa  517  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  41.34 
 
 		 670 aa  514  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  38.1 
 
 		 684 aa  515  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  39.97 
 
 		 661 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0712  DNA ligase, NAD-dependent  42.07 
 
 		 668 aa  511  1e-143  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  38.31 
 
 		 681 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  37.84 
 
 		 680 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1480  DNA ligase, NAD-dependent  40.69 
 
 		 663 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  42.27 
 
 		 664 aa  506  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0427  NAD-dependent DNA ligase  38.57 
 
 		 684 aa  508  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.89 
 
 		 648 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  39.16 
 
 		 672 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  41.95 
 
 		 704 aa  504  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1926  hypothetical protein  38.26 
 
 		 671 aa  499  1e-140  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  37.52 
 
 		 671 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.99 
 
 		 679 aa  499  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  38.99 
 
 		 685 aa  501  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  39 
 
 		 668 aa  497  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.26 
 
 		 680 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.78 
 
 		 738 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.93 
 
 		 680 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2093  DNA ligase, NAD-dependent  37.85 
 
 		 705 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1670  DNA ligase NAD-dependent  40.06 
 
 		 666 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  39.88 
 
 		 673 aa  490  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  37 
 
 		 694 aa  492  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0475  DNA ligase, NAD-dependent  38.12 
 
 		 676 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  37.76 
 
 		 673 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  37.97 
 
 		 667 aa  488  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0004  DNA ligase, NAD-dependent  38.07 
 
 		 675 aa  487  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  37.46 
 
 		 718 aa  485  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  39.88 
 
 		 670 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  38.52 
 
 		 673 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0473  DNA ligase, NAD-dependent  37.12 
 
 		 686 aa  484  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  37.61 
 
 		 673 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  38.92 
 
 		 672 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  36.9 
 
 		 673 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0427  DNA ligase, NAD-dependent  36.68 
 
 		 675 aa  485  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  35.88 
 
 		 712 aa  481  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3466  DNA ligase, NAD-dependent  39.47 
 
 		 689 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184307  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.36 
 
 		 652 aa  479  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.43 
 
 		 670 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  36.36 
 
 		 673 aa  482  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.41 
 
 		 671 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  37.22 
 
 		 690 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  36.89 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.57 
 
 		 671 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  37.61 
 
 		 690 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  38.63 
 
 		 670 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>