16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4244 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4244  chromosome segregation ATPase-like protein  100 
 
 		 287 aa  568  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.164792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4392  BRCT domain protein  34.9 
 
 		 783 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  50 
 
 		 351 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  18.14 
 
 		 1193 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  23.88 
 
 		 1621 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  21.59 
 
 		 1196 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  19.02 
 
 		 1192 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  20 
 
 		 1146 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  28 
 
 		 1189 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3945  GUN4-like  31.58 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0311749 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0383  hypothetical protein  24.86 
 
 		 476 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0266002  hitchhiker  0.0000000000664805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.68 
 
 		 1191 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.67 
 
 		 2468 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00810  ER to Golgi transport-related protein, putative  27.62 
 
 		 1057 aa  42.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  24.66 
 
 		 1154 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1182  hypothetical protein  32.58 
 
 		 109 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0320291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>