15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00810 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN00810  ER to Golgi transport-related protein, putative  100 
 
 
1057 aa  2118    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06323  P150 dynactin NUDM [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0T2]  35.53 
 
 
1267 aa  79  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.263626 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46726  predicted protein  47.89 
 
 
1327 aa  76.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33838  predicted protein  40.43 
 
 
889 aa  67.4  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0040379  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_006686  CND01810  Dynactin, putative  26.98 
 
 
1263 aa  65.1  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02000  tubulin-folding cofactor B, putative  41.77 
 
 
239 aa  57.4  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.078405  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01475  Clip 170 homolog (Eurofung)  37.23 
 
 
668 aa  54.3  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.529442 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04520  centromeric protein e (cenp-e protein), putative  28.36 
 
 
1801 aa  53.1  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05116  cell polarity protein (Alp11), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07580)  50 
 
 
272 aa  52  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30513  predicted protein  35.71 
 
 
255 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.800594  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  20.89 
 
 
7659 aa  51.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01400  conserved hypothetical protein  28.75 
 
 
1057 aa  47.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1392  2 domain protein  23.4 
 
 
252 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1426  hypothetical protein  23.4 
 
 
252 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0054  hypothetical protein  21.27 
 
 
333 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>