45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1963 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  100 
 
 		 348 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  41.19 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  39.66 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  37.47 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  39.18 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  27.89 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  30.84 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  30 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  29.71 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  29.95 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  29.09 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  28.77 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  30.47 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1990  hypothetical protein  30.16 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0562007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  29.05 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  28.7 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  30.48 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  27.13 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  26.59 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  29 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  25.58 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  30.67 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  30.59 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  26.11 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4392  BRCT domain protein  23.67 
 
 		 783 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  48.89 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  32.4 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  25.74 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  25.74 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  28.37 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  38.03 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  28.1 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3043  putative cointegrate resolution protein  35.23 
 
 		 291 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1887  hypothetical protein  31.15 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3578  mucin-associated surface protein  38.3 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00254533  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2778  hypothetical protein  23.94 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.329105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0952  hypothetical protein  35.85 
 
 		 771 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0922  hypothetical protein  35.85 
 
 		 771 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0994  KfrAs  26.8 
 
 		 205 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0971877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1892  hypothetical protein  28.47 
 
 		 207 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  44.9 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  20.75 
 
 		 1621 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  20.78 
 
 		 567 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  40.82 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4171  hypothetical protein  28.79 
 
 		 342 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>