29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25690 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  100 
 
 		 340 aa  654    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  46.47 
 
 		 334 aa  245  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  53.85 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  52.1 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  50.36 
 
 		 300 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  53.21 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  44.81 
 
 		 336 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  49.12 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  48.75 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  46.31 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  49.83 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  53.36 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  41.84 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  41.84 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  42.68 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  42.44 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  46.89 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  44.94 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  39.35 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  43.7 
 
 		 391 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  28.94 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  28.93 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0193  cointegrate resolution protein T  52.7 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  27.24 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  28.74 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  33.21 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  28.4 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  28.64 
 
 		 380 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4171  hypothetical protein  35.62 
 
 		 342 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>