21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0193 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0193  cointegrate resolution protein T  100 
 
 		 230 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  46.26 
 
 		 391 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  35.53 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  36.31 
 
 		 330 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  44.44 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  60.94 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  36.81 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  36.81 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  33.33 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  55.38 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  52.7 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  57.33 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  44.19 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  59.09 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  36.99 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  63.64 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  55.38 
 
 		 326 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  49.18 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  66.13 
 
 		 333 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  70.59 
 
 		 332 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  56.92 
 
 		 326 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>