32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2522 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  96.65 
 
 		 328 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  93.56 
 
 		 326 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  77.5 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  55.56 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  47.59 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  52.51 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  49.12 
 
 		 340 aa  215  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  46.04 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  47.56 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  53.52 
 
 		 333 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  51.04 
 
 		 336 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  39.7 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  44.62 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  46.25 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  47.83 
 
 		 362 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  47.83 
 
 		 362 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  40.59 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  42.48 
 
 		 391 aa  143  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  37.84 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0193  cointegrate resolution protein T  55.38 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  31.94 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  30.54 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  30.5 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  28.76 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  28.38 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  28.25 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  30.22 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  39.24 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  28.93 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  38.96 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4171  hypothetical protein  51.72 
 
 		 342 aa  42.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>