35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2488 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  100 
 
 		 365 aa  717    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  51.81 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  51.81 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  51.27 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  50.19 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  51.22 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  40.33 
 
 		 328 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  39.75 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  44.44 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  40.55 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  40.89 
 
 		 328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  42.47 
 
 		 300 aa  143  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  43.3 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  41.7 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  47.33 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  44.01 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  41.55 
 
 		 326 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  44.94 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  45.45 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  40.77 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  28.03 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0193  cointegrate resolution protein T  35.53 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  26.91 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  27.57 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  30.66 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  27.38 
 
 		 348 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  25.33 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  44.64 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  26.45 
 
 		 350 aa  49.3  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  45.45 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1887  hypothetical protein  28.17 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  43.48 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  42.31 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  43.18 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  43.18 
 
 		 343 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>