38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1383 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  745    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  37.25 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  36.49 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  37.26 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  36.06 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  33.33 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  28.03 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  31.84 
 
 		 348 aa  93.2  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  26.9 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  27.31 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  31.98 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  28.4 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  29.34 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  28.57 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  33.85 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  28.75 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  34.18 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  26.23 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  26.23 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  30.24 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  31.02 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  29.38 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  29.6 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  41.43 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  30.29 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  28.38 
 
 		 300 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  47.92 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4171  hypothetical protein  29.27 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  19.12 
 
 		 1177 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1887  hypothetical protein  31.03 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1892  hypothetical protein  53.33 
 
 		 207 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3578  mucin-associated surface protein  46 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00254533  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  35.21 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  32.1 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2778  hypothetical protein  30 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.329105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  40 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  42.86 
 
 		 296 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4218  hypothetical protein  32.95 
 
 		 347 aa  42.7  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>