19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0184 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  25.29 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  25.95 
 
 
350 aa  59.3  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  31.78 
 
 
349 aa  56.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  41.43 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  26.92 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  25.96 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  25.25 
 
 
351 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1887  hypothetical protein  48.89 
 
 
321 aa  49.7  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  29.09 
 
 
335 aa  49.7  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  28.18 
 
 
343 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  28.18 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  24.24 
 
 
1082 aa  46.2  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  40.82 
 
 
296 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  21.74 
 
 
3060 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  33.75 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1892  hypothetical protein  30.61 
 
 
207 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  44.9 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  42.31 
 
 
365 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>