27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6604 on replicon NC_008385
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  99.71 
 
 		 343 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  81.27 
 
 		 335 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0020  hypothetical protein  35.58 
 
 		 403 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4218  hypothetical protein  34.35 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2713  hypothetical protein  33.43 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0140872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2343  hypothetical protein  35.06 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.671836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1892  hypothetical protein  31.55 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2361  hypothetical protein  33.53 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206277  hitchhiker  0.0000361585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  31.64 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  35.02 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  27.21 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1412  hypothetical protein  48.09 
 
 		 154 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0007  TlpA  29.11 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.21191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0994  KfrAs  37.4 
 
 		 205 aa  53.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0971877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  25.58 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1497  mucin-associated surface protein  34.45 
 
 		 281 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000680781 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  24.39 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  28.18 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  35.62 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5039  hypothetical protein  63.49 
 
 		 102 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  36.49 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  29.03 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5355  DNA-binding protein KrfA  32.82 
 
 		 213 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1803  hypothetical protein  34.94 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000895551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  29.95 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  43.18 
 
 		 365 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>