12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2343 on replicon NC_011667
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2343  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.671836  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2361  hypothetical protein  83.96 
 
 
304 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206277  hitchhiker  0.0000361585 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0020  hypothetical protein  49.19 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  34.66 
 
 
343 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  34.38 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  32.67 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1412  hypothetical protein  42.14 
 
 
154 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  29.92 
 
 
985 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4637  hypothetical protein  34.51 
 
 
214 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1104  chromosome segregation ATPase-like protein  21.05 
 
 
1359 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2452  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.57 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.633418  normal  0.137413 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  20.49 
 
 
1143 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>