31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4307 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  627  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  81.57 
 
 
343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  81.27 
 
 
343 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0020  hypothetical protein  35.48 
 
 
403 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4218  hypothetical protein  32.94 
 
 
347 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1892  hypothetical protein  41.49 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2343  hypothetical protein  33.81 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.671836  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2713  hypothetical protein  41.54 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0140872  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2361  hypothetical protein  33.03 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206277  hitchhiker  0.0000361585 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0007  TlpA  29.44 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.21191  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  28.88 
 
 
301 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1412  hypothetical protein  45.26 
 
 
154 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  27.7 
 
 
380 aa  53.5  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  26.62 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0994  KfrAs  34.09 
 
 
205 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0971877  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  25.31 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  26.12 
 
 
350 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  25 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  29.09 
 
 
346 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  26.29 
 
 
351 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  33.87 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  35.62 
 
 
327 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  27.68 
 
 
365 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6751  Chromosome segregation ATPase-like protein  30.42 
 
 
949 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.510107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2767  hypothetical protein  28.99 
 
 
774 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1104  chromosome segregation ATPase-like protein  20.83 
 
 
1359 aa  43.9  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1887  hypothetical protein  30.92 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  33.78 
 
 
296 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1990  hypothetical protein  25.62 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0562007  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  25.96 
 
 
349 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.55 
 
 
1184 aa  42.7  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>