39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3967 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  100 
 
 
349 aa  702    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  79.94 
 
 
349 aa  557  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  80.8 
 
 
349 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  73.07 
 
 
351 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  38.83 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4151  hypothetical protein  83.16 
 
 
95 aa  159  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  35.58 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  36.06 
 
 
380 aa  96.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  33.47 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  32.77 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  32.11 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  29.68 
 
 
340 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  30 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  27.7 
 
 
391 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  29.54 
 
 
330 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  25.76 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  27.98 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  25.76 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  28.06 
 
 
333 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  26.96 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1887  hypothetical protein  37.72 
 
 
321 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1990  hypothetical protein  28.3 
 
 
337 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0562007  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  28.11 
 
 
300 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  27.86 
 
 
332 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  33.73 
 
 
327 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  28.57 
 
 
326 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  32.9 
 
 
297 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  29.59 
 
 
328 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  31.3 
 
 
325 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1892  hypothetical protein  31.87 
 
 
207 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  29.56 
 
 
332 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  36.47 
 
 
346 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  44.44 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  42.11 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  29.58 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  35.42 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0994  KfrAs  28.41 
 
 
205 aa  46.2  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0971877  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3578  mucin-associated surface protein  40 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00254533  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3043  putative cointegrate resolution protein  30.12 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>