17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0994 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0994  KfrAs  100 
 
 		 205 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0971877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0031  hypothetical protein  36.48 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4968  hypothetical protein  39.22 
 
 		 282 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  36.22 
 
 		 343 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  28.65 
 
 		 349 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  36.8 
 
 		 343 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  35.58 
 
 		 335 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  28.41 
 
 		 349 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  28.88 
 
 		 349 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  26.8 
 
 		 348 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4218  hypothetical protein  34.48 
 
 		 347 aa  45.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2713  hypothetical protein  38.14 
 
 		 319 aa  44.7  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0140872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0020  hypothetical protein  32.97 
 
 		 403 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6751  Chromosome segregation ATPase-like protein  31.52 
 
 		 949 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.510107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5355  DNA-binding protein KrfA  30.53 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2767  hypothetical protein  35.16 
 
 		 774 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  27.27 
 
 		 351 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>