15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4218 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4218  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  658    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2713  hypothetical protein  46.95 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0140872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  35.71 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  36.31 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  32.35 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2767  hypothetical protein  32.74 
 
 		 774 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1892  hypothetical protein  29.65 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6751  Chromosome segregation ATPase-like protein  30.94 
 
 		 949 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.510107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0994  KfrAs  34.48 
 
 		 205 aa  49.7  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0971877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2343  hypothetical protein  32.09 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.671836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.09 
 
 		 1178 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2136  hypothetical protein  26.75 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.82564  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  32.95 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  26 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  28.64 
 
 		 351 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>