38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02952 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  100 
 
 		 349 aa  701    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  79.94 
 
 		 349 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  76.79 
 
 		 349 aa  527  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  69.34 
 
 		 351 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  39.66 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4151  hypothetical protein  76.84 
 
 		 95 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  34.43 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  94  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  30.05 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  32.7 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  28.8 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  33.59 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  26.05 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  26.84 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  26.05 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  28.74 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  26.09 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1990  hypothetical protein  26.11 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0562007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  25.33 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  27.27 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  33.73 
 
 		 327 aa  52.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  25.12 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  35.24 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  28.25 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  36.17 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  38.57 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1887  hypothetical protein  39.36 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  32.5 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  28.05 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  46.94 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0994  KfrAs  28.65 
 
 		 205 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0971877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  27.23 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  27.54 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  27.92 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  28.64 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1892  hypothetical protein  31.87 
 
 		 207 aa  46.2  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3578  mucin-associated surface protein  38.18 
 
 		 293 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00254533  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  28.02 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>