30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2250 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  57.58 
 
 		 332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  60.54 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  57.24 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  50.36 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  47.59 
 
 		 328 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  48.82 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  47.24 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  47.93 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  46.64 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  46.71 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  47.88 
 
 		 336 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  43.82 
 
 		 330 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  38.71 
 
 		 330 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  44.76 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  44.76 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  46.98 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  43.75 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  42.31 
 
 		 365 aa  148  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  42.86 
 
 		 391 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  28.88 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  29.86 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0193  cointegrate resolution protein T  44.19 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  27.14 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  29.14 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  28.11 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  27.96 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  29.26 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0595  chromosome segregation ATPases-like  20 
 
 		 1675 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.401487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>