30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3057 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  100 
 
 		 333 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  75.38 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  81.08 
 
 		 332 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  57.24 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  52.1 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  50.15 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  54.37 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  48.54 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  47.29 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  56.27 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  53.44 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  47.79 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  48.37 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  42.64 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  42.64 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  46.22 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  43.49 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  48.1 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  45.28 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  40 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0193  cointegrate resolution protein T  62.12 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  29.32 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  28.39 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  29.91 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  29.55 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  30.14 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  31.1 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  28.46 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  37.04 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4171  hypothetical protein  42 
 
 		 342 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>