25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2275 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  100 
 
 		 324 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  44.31 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  48.05 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  46.44 
 
 		 336 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  47.01 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  41.78 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  40.53 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  46.58 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  43.98 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  40.48 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  40.08 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  39.29 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  41.18 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  41.18 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  40.78 
 
 		 365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  38.25 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  41.7 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  37.11 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  38.43 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  37.37 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0193  cointegrate resolution protein T  49.18 
 
 		 230 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  28.94 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  31.72 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  28.08 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  48.94 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>