34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1773 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  100 
 
 		 330 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  84.55 
 
 		 330 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  51.22 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  47.39 
 
 		 334 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  47.92 
 
 		 339 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  39.32 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  48.35 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  48.35 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  40.91 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  38.71 
 
 		 300 aa  172  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  40 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  46.32 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  43.69 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  45.12 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1831  cointegrate resolution protein T  73.45 
 
 		 113 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  45.8 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  42.44 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  46.64 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  46.22 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  34.01 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  37.19 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0193  cointegrate resolution protein T  36.31 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  28.57 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  29.53 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  33.59 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  28.86 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  29.54 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  33.59 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  28.37 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  30.29 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4171  hypothetical protein  38.18 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  27.37 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  28.33 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0849  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1193 aa  42.7  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>