30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00631 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  100 
 
 
339 aa  649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  55.74 
 
 
362 aa  225  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  55.74 
 
 
362 aa  225  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  50.19 
 
 
365 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  50.21 
 
 
330 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  47.92 
 
 
330 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  46.25 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  43.32 
 
 
334 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  46.67 
 
 
328 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  45.83 
 
 
326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  44.14 
 
 
300 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  46.67 
 
 
332 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  45.99 
 
 
336 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  45.17 
 
 
332 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  45.38 
 
 
336 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  47.08 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  39.35 
 
 
340 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  37.9 
 
 
326 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  42.73 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  38.87 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0193  cointegrate resolution protein T  60.94 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  29.13 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  30.7 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  28.52 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  27.23 
 
 
349 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  29.58 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  29.03 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  27.1 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4171  hypothetical protein  40.32 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  46.81 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>