29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2378 on replicon NC_011667
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  100 
 
 		 362 aa  696    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  100 
 
 		 362 aa  696    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  51.81 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  56.22 
 
 		 339 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  49.58 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  48.35 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  47.11 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  48.35 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  39.7 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  46.28 
 
 		 326 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  42.48 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  44.49 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  45.27 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  47.48 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  45.67 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  43.64 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  47.35 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  42.91 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  34.93 
 
 		 391 aa  136  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  39.53 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0193  cointegrate resolution protein T  36.81 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  26.09 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  26.76 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  27.63 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  26.82 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  28.4 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  27.31 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  28.96 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4171  hypothetical protein  40.68 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>