More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2844 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2844  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 707 aa  1448    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.764742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  45.86 
 
 		 672 aa  578  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  44.4 
 
 		 673 aa  550  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  43.36 
 
 		 671 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  43.43 
 
 		 663 aa  548  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.08 
 
 		 670 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  42.69 
 
 		 672 aa  545  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.08 
 
 		 670 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  43.07 
 
 		 668 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.23 
 
 		 670 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  43.87 
 
 		 673 aa  546  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  42.5 
 
 		 673 aa  542  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  43.07 
 
 		 668 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  44.48 
 
 		 666 aa  543  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  41.33 
 
 		 663 aa  544  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  42.94 
 
 		 683 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.36 
 
 		 670 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  43.29 
 
 		 670 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  42.32 
 
 		 670 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  42.24 
 
 		 681 aa  536  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  42.21 
 
 		 670 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  43.57 
 
 		 671 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  43.6 
 
 		 694 aa  537  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.77 
 
 		 671 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  42.63 
 
 		 671 aa  532  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  42.77 
 
 		 671 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  42.86 
 
 		 670 aa  532  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.21 
 
 		 670 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.63 
 
 		 671 aa  532  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.05 
 
 		 671 aa  532  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.01 
 
 		 671 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.77 
 
 		 671 aa  534  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  42.08 
 
 		 706 aa  535  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  43.24 
 
 		 661 aa  532  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  42.42 
 
 		 662 aa  531  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.48 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  42.84 
 
 		 671 aa  528  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.64 
 
 		 673 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  43.08 
 
 		 685 aa  530  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  41.65 
 
 		 683 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.48 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  40.98 
 
 		 678 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.5 
 
 		 671 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  42.73 
 
 		 675 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  42.44 
 
 		 691 aa  527  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.29 
 
 		 671 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.44 
 
 		 671 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  41.88 
 
 		 690 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  41.74 
 
 		 690 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.14 
 
 		 671 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.35 
 
 		 671 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  42.04 
 
 		 671 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  42.67 
 
 		 690 aa  522  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  42.48 
 
 		 672 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  41.51 
 
 		 689 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  42.13 
 
 		 681 aa  519  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  42.07 
 
 		 711 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  42.58 
 
 		 677 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  40.6 
 
 		 691 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  41.3 
 
 		 674 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  42.09 
 
 		 693 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  40.23 
 
 		 677 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  41.43 
 
 		 691 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  40.46 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  40.75 
 
 		 684 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  40.46 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  40.46 
 
 		 691 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  40.78 
 
 		 704 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  40.46 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  40.56 
 
 		 684 aa  518  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.79 
 
 		 681 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  40.32 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  42.63 
 
 		 673 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  40.46 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  40.46 
 
 		 691 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  41.75 
 
 		 672 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 659 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  41.5 
 
 		 685 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  42.8 
 
 		 718 aa  515  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0004  DNA ligase, NAD-dependent  42.11 
 
 		 675 aa  512  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.58 
 
 		 679 aa  515  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  40.87 
 
 		 685 aa  512  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.43 
 
 		 681 aa  512  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  42.45 
 
 		 726 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3592  DNA ligase, NAD-dependent  40.31 
 
 		 703 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0307521  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.52 
 
 		 669 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0463  DNA ligase, NAD-dependent  43.31 
 
 		 684 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.29 
 
 		 669 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  41.06 
 
 		 707 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  41.87 
 
 		 678 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  42.56 
 
 		 673 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.29 
 
 		 669 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.14 
 
 		 669 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  41.5 
 
 		 685 aa  512  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.14 
 
 		 669 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  40.32 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  41.98 
 
 		 712 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.85 
 
 		 673 aa  509  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  42.61 
 
 		 695 aa  510  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.68 
 
 		 676 aa  508  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>