273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0519 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0519  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 478 aa  953    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0488  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  30.84 
 
 		 601 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3236  tetratricopeptide TPR_4  30.51 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.789976  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0492  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154426 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.87 
 
 		 810 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 878 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.09 
 
 		 2240 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 		 632 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 767 aa  70.1  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 2262 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1676 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.74 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  25.2 
 
 		 648 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.1 
 
 		 936 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 827 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  18.73 
 
 		 1737 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  24.89 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 685 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 2262 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.81 
 
 		 818 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.29 
 
 		 1694 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  21.51 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  21.51 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  18.46 
 
 		 676 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  19.94 
 
 		 681 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  34.69 
 
 		 734 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 3172 aa  57  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  18.54 
 
 		 832 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.78 
 
 		 689 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  20.33 
 
 		 909 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 1827 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.04 
 
 		 725 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  30.97 
 
 		 1067 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.58 
 
 		 1154 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.68 
 
 		 557 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 715 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 718 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  20.45 
 
 		 321 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 614 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.65 
 
 		 626 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 847 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 615 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 614 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3145 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 750 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  20 
 
 		 733 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  30.97 
 
 		 586 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.54 
 
 		 565 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 824 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.5 
 
 		 622 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 754 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 597 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.06 
 
 		 887 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.14 
 
 		 573 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.81 
 
 		 836 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 612 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.14 
 
 		 626 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 613 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  21.01 
 
 		 875 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 620 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.79 
 
 		 626 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.14 
 
 		 614 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.14 
 
 		 614 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  27.33 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 614 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  26.53 
 
 		 682 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  26.67 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  22.61 
 
 		 638 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 1238 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 4079 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 828 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  19.72 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.87 
 
 		 988 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 808 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  27.96 
 
 		 937 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 767 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.97 
 
 		 1056 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  23.35 
 
 		 603 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 636 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  20.47 
 
 		 816 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.17 
 
 		 884 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 626 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 565 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  19.39 
 
 		 3301 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.4 
 
 		 661 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 635 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.61 
 
 		 784 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 637 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 635 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  20.87 
 
 		 637 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.59 
 
 		 1764 aa  50.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 639 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.54 
 
 		 589 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  25.42 
 
 		 508 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>