More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0492 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0492  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 586 aa  1144    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  30.47 
 
 		 601 aa  214  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3236  tetratricopeptide TPR_4  30.54 
 
 		 514 aa  173  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.789976  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0519  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0488  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 485 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 637 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 878 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.54 
 
 		 816 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 681 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 1486 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.28 
 
 		 810 aa  87.4  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.18 
 
 		 725 aa  85.1  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 714 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.89 
 
 		 2240 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 3145 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 909 aa  80.5  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1676 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.02 
 
 		 865 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.59 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 934 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 685 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.23 
 
 		 1737 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.73 
 
 		 764 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 602 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.37 
 
 		 622 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 824 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1406 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 3560 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 1198 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.44 
 
 		 626 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.95 
 
 		 603 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 		 614 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 614 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 		 614 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 614 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 614 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 		 626 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  27.33 
 
 		 714 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25 
 
 		 935 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.47 
 
 		 1694 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.91 
 
 		 689 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  22.34 
 
 		 733 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 739 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.25 
 
 		 3172 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.31 
 
 		 883 aa  67.4  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 828 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  23.81 
 
 		 661 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 886 aa  67  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 601 aa  67  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 3035 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 612 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  24.92 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 828 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 646 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 879 aa  65.1  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  24.53 
 
 		 762 aa  64.7  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 686 aa  64.7  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  22.62 
 
 		 643 aa  64.3  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.53 
 
 		 762 aa  64.7  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.77 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 792 aa  63.9  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 2262 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.39 
 
 		 837 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 649 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 708 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.05 
 
 		 602 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 649 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 323 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 1085 aa  62.4  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.55 
 
 		 936 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 542 aa  62  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 808 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 718 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.36 
 
 		 929 aa  61.6  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 754 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 700 aa  61.2  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 		 3301 aa  60.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.11 
 
 		 875 aa  60.5  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 480 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 265 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 789 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.79 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  27.44 
 
 		 1237 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 596 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 2262 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.34 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 566 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  25.68 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 620 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 		 1252 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  31.25 
 
 		 704 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  22.24 
 
 		 937 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.43 
 
 		 887 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>