More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1595 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1595  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 281 aa  577  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.352603  normal  0.949342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3309  transcriptional regulator, LysR family  48.23 
 
 		 283 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2199  LysR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4473  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5068  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.728384 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3076  transcriptional regulator  31.7 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.513194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2990  HTH-type transcriptional regulator  32.68 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3233  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3346  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2441  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1884  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000190321  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1836  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000103059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1950  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  normal  0.030866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2350  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1790  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971037  normal  0.169978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3644  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1850  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138291  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8398  transcriptional regulator, LysR family  31.52 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40550  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 287 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1746  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3438  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3498  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.4 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.30302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51150  LysR family transcriptional regulator protein  31.13 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.390095  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2202  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0429  LysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0398764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2193  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0865555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2403  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0937382  normal  0.998699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3128  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2270  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5373  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0478258  normal  0.118386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3159  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358465  normal  0.467321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1997  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2328  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.475016 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06999  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000959  transcriptional regulator LysR family  24.81 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000225633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3087  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964725 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2309  regulatory protein, LysR  27.41 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000228634  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1482  transcriptional regulator, LysR family protein  28.32 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0151  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0562554  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0220  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3668  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.013804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3779  transcriptional regulator HdfR  28.38 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0134  transcriptional regulator HdfR  28.57 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4108  transcriptional regulator HdfR  25.8 
 
 		 278 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4288  transcriptional regulator HdfR  25.8 
 
 		 278 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4180  transcriptional regulator HdfR  25.44 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4123  transcriptional regulator HdfR  25.44 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4229  transcriptional regulator HdfR  25.44 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4064  transcriptional regulator HdfR  26.84 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0478  transcriptional regulator HdfR  26.84 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.76751  normal  0.0689063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0150  transcriptional regulator HdfR  26.84 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.275664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2759  transcriptional regulator of LysR family protein  23.88 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.219454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3186  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.992217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2897  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000450249  normal  0.952694 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0178  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  24.39 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4764  transcriptional regulator HdfR  27.56 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4225  transcriptional regulator HdfR  26.34 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4155  transcriptional regulator HdfR  26.32 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03642  transcriptional regulator HdfR  26.32 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.653155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4211  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4238  transcriptional regulator HdfR  26.32 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115223  normal  0.0994443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5199  transcriptional regulator HdfR  26.32 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4276  transcriptional regulator HdfR  26.32 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.669275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4131  transcriptional regulator HdfR  26.32 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.136622  normal  0.368379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3981  transcriptional regulator HdfR  26.32 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03591  hypothetical protein  26.32 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.732971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4035  transcriptional regulator HdfR  27.31 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1323  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1236  transcriptional regulator, LysR family  31.11 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.387856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4018  transcriptional regulator HdfR  25.1 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0119675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2148  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  26.86 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3575  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5490  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4731  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4792  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0423  LysR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05533  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4176  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4698  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.981446 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1794  transcriptional regulator, LysR family  28.02 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4360  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623991  normal  0.557987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2549  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 619 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.33908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30450  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  33.14 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4333  LysR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5230  LysR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957267  normal  0.114688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>