More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3087 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3087  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  577  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1997  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1884  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 289 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000190321  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2441  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1850  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1836  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000103059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2202  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1482  transcriptional regulator, LysR family protein  35.74 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1746  LysR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2403  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0937382  normal  0.998699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2193  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0865555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2270  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2897  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000450249  normal  0.952694 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0220  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2309  regulatory protein, LysR  36.54 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000228634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3668  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.013804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0178  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000959  transcriptional regulator LysR family  33.45 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000225633  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06999  transcriptional regulator  33.97 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2759  transcriptional regulator of LysR family protein  35.11 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.219454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3076  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.513194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4473  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 		 288 aa  151  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0134  transcriptional regulator HdfR  34.18 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3779  transcriptional regulator HdfR  33.82 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3644  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5068  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.728384 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2328  transcriptional regulator  33.58 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.475016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3159  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358465  normal  0.467321 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4155  transcriptional regulator HdfR  32.37 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1950  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  normal  0.030866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4018  transcriptional regulator HdfR  32.31 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0119675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03642  transcriptional regulator HdfR  32.01 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.653155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4211  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4238  transcriptional regulator HdfR  32.01 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115223  normal  0.0994443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03591  hypothetical protein  32.01 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.732971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3346  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3981  transcriptional regulator HdfR  32.01 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4108  transcriptional regulator HdfR  32.37 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4131  transcriptional regulator HdfR  32.01 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.136622  normal  0.368379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5199  transcriptional regulator HdfR  32.01 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4276  transcriptional regulator HdfR  32.01 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.669275  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4288  transcriptional regulator HdfR  32.01 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4229  transcriptional regulator HdfR  32.01 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4180  transcriptional regulator HdfR  32.01 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4123  transcriptional regulator HdfR  32.01 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2350  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3128  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4064  transcriptional regulator HdfR  32.99 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0150  transcriptional regulator HdfR  32.99 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.275664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0478  transcriptional regulator HdfR  32.99 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.76751  normal  0.0689063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3233  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1790  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971037  normal  0.169978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2990  HTH-type transcriptional regulator  33.83 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4225  transcriptional regulator HdfR  33.09 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4035  transcriptional regulator HdfR  33.09 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4764  transcriptional regulator HdfR  32.85 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51150  LysR family transcriptional regulator protein  31.54 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.390095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0429  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0398764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3438  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8398  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40550  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5373  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0478258  normal  0.118386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3498  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.27 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.30302  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3186  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.992217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3309  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1102  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2199  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0151  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0562554  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1595  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.352603  normal  0.949342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2120  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.184045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  26.39 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  28.17 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  30.81 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 320 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 316 aa  85.5  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  29.78 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.47 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  25.54 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  26.28 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  27.14 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46170  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0324298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>