92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1148 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  100 
 
 		 308 aa  622  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.99 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.8 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  26.36 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.81 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.43 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  29.17 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  27.96 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  29.38 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.39 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  25.45 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.63 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  29.73 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.69 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  30.14 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  28.24 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.78 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  29.05 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  29.92 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  27.59 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  30 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  29.92 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  29.58 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.67 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  24.04 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.67 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  28.35 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.6 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  25.7 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  28.77 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.46 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  30.08 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  30.23 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  30 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  27.34 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  25.93 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  28.08 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  30 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.77 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  25.58 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  25 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.81 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  28.65 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  25.79 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.33 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.67 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  30.99 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.81 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.4 
 
 		 256 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.74 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1196  hypothetical protein  26.63 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  25.4 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0859  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.1 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  26.4 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  25 
 
 		 254 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.79 
 
 		 320 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  27.64 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.96 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.39 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  20.66 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  26.59 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  19.12 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0960  conserved hypothetical lipoprotein  24.04 
 
 		 218 aa  46.6  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.490847  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  29.66 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  21.89 
 
 		 281 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.22 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.5 
 
 		 258 aa  45.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  23 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  23.72 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  23.72 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.33 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0465  hypothetical protein  40 
 
 		 446 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.12 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0413  DNA uptake lipoprotein-like  26.39 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  22.64 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  22.5 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  21.84 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1371  competence lipoprotein ComL  25.79 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  30.67 
 
 		 271 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  27.97 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0550  competence lipoprotein  25 
 
 		 212 aa  42.7  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0802793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.32 
 
 		 244 aa  42.7  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  22.22 
 
 		 257 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>