234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2065 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  100 
 
 
243 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  66.67 
 
 
243 aa  345  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0400  putative lipoprotein  63.56 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  60.71 
 
 
244 aa  292  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1201  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  52.67 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00280103  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.26 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  36.95 
 
 
255 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  37.93 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.34 
 
 
248 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 
246 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  30.73 
 
 
258 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  32.02 
 
 
302 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.4 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  31.53 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.25 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.65 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.73 
 
 
285 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.98 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  29.07 
 
 
289 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.09 
 
 
319 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  28.5 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.51 
 
 
243 aa  89  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.51 
 
 
243 aa  89  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.51 
 
 
243 aa  89  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.37 
 
 
258 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  31.78 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.5 
 
 
273 aa  86.3  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.57 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  26.91 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.16 
 
 
262 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.16 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.12 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.23 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.81 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  29.14 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  29.14 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004395  probable component of the lipoprotein assembly complex (forms a complex with YaeT YfgL and NlpB)  25.46 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  29.51 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.58 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.58 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.58 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.58 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  26.96 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  30.39 
 
 
268 aa  82  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.68 
 
 
244 aa  82  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  28.43 
 
 
254 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  28.43 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  26.21 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.58 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  25.12 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.12 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.12 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.12 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  25.12 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.12 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.12 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.62 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  29.74 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.12 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  29.74 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.12 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01004  hypothetical protein  25.35 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  25.6 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2347  putative competence lipoprotein, ComL  29.28 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0433334 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  28.18 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  30.68 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  28.64 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  28.64 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.64 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.64 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  26.81 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  29.49 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  29.35 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  25.82 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  25.82 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  26.07 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  24.52 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  26.88 
 
 
268 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  26.83 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  27.91 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  29.35 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  29.35 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  29.35 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  29.35 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  29.35 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  29.35 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  29.35 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  25.11 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1480  competence lipoprotein ComL  29.23 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124446  normal  0.0477124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0237  putative lipoprotein  25.93 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.558058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  26.39 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  26.39 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.23 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4641  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.33 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.39 
 
 
339 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.27 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0663  outer membrane protein  26.4 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000502796  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  26.74 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>