59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2489 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
299 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  57.33 
 
 
301 aa  338  8e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  48.31 
 
 
298 aa  267  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  48.29 
 
 
287 aa  264  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  43.24 
 
 
298 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  44 
 
 
306 aa  230  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  42.36 
 
 
311 aa  228  7e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.21 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.9 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  28.47 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  25.78 
 
 
277 aa  62.4  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  23.99 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.31 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  32.37 
 
 
270 aa  59.3  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.27 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.22 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.3 
 
 
243 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.3 
 
 
243 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.3 
 
 
243 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.33 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.75 
 
 
245 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.75 
 
 
245 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.75 
 
 
245 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.75 
 
 
245 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.75 
 
 
245 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  21.37 
 
 
245 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  23.85 
 
 
293 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.6 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  23.6 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.7 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.6 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.6 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  23.6 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.6 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.6 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.6 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  22.59 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.6 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.58 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.2 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  22.07 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.07 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.91 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.73 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  23.15 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  27.89 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4498  Tetratricopeptide domain protein  27.66 
 
 
284 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  21.77 
 
 
262 aa  47  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  24.4 
 
 
267 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  22.66 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.12 
 
 
1000 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  22.65 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3602  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.310162  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  23.58 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  22.27 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.73 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.65 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  21.67 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.22 
 
 
243 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>