79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1502 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 268 aa  534  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  49.62 
 
 		 264 aa  250  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  42.22 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.43 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  29.78 
 
 		 270 aa  125  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.66 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1196  hypothetical protein  30.83 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1307  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.28 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.56 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.15 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  27.24 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  27.06 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  26.82 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  29.05 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  26.46 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.16 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.17 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.35 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  27.49 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  26.98 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  27.91 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.87 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0859  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  28.33 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  26.07 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  27.44 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  27.81 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  29.83 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  27.03 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  29.08 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  28.51 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.55 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  27.22 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  23.39 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  27.61 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  22.47 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.46 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.89 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  25.52 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.42 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  23.17 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.31 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.88 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.81 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.6 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  23.36 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  23.9 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.18 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  27.18 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  26.4 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  24.06 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  21.96 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  24.44 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  26.97 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  24.44 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  23.53 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  26.51 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  21.35 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4641  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.8 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.77 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  23.66 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  21.8 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  22.35 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.32 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  21.3 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  26.55 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.11 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  23.22 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  20.95 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>