62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1145 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 309 aa  623  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1307  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.93 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.1 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.62 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  39.74 
 
 		 264 aa  156  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  33.33 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  33.21 
 
 		 277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1196  hypothetical protein  33.46 
 
 		 267 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.52 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.27 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  25.4 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.88 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  26.55 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.6 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  25.85 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  24.65 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.13 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  25 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  22.11 
 
 		 255 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  28 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  25.55 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  24.91 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.32 
 
 		 248 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  26.64 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  25 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.97 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  23.53 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  25 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 278 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  25.61 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  28 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  30.99 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  26.04 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  29.93 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  27.08 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  22.22 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  29.58 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.58 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  28.15 
 
 		 283 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  23.22 
 
 		 288 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.31 
 
 		 302 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  28.05 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  23.92 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  30.43 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.05 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  31.4 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  23.5 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  21.43 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  26.69 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  21.92 
 
 		 235 aa  43.5  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  31.48 
 
 		 248 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.99 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  24.21 
 
 		 261 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>