78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2240 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 301 aa  615  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  57.33 
 
 		 299 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  47.45 
 
 		 298 aa  256  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  46.99 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  42.91 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  37.02 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.8 
 
 		 280 aa  96.3  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.21 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.07 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  28.27 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.69 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.65 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  26.07 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  28.87 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  22.54 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  22.4 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3602  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 345 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.310162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  40.74 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  37.78 
 
 		 268 aa  52.8  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.94 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.94 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.94 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  22.92 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  22.84 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.84 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  21.93 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  21.93 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  21.93 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  26.21 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  34.48 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1849  hypothetical protein  26.35 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.26456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  34.57 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  32.22 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.22 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  32.18 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  21.93 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  21.93 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.55 
 
 		 243 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 265 aa  45.8  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  21.48 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  34.18 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  20.82 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.33 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.45 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.45 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.45 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.45 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.45 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  20.82 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  20.82 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.62 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.04 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  20.82 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  21.33 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.45 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.45 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  22.45 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.45 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.45 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.14 
 
 		 572 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.45 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  22.45 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.45 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.45 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  21.23 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  25.85 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.92 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.14 
 
 		 572 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  23.45 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.12 
 
 		 244 aa  42.4  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>