114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3469 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  48.53 
 
 		 277 aa  251  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  49.62 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.74 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.52 
 
 		 320 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1307  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.96 
 
 		 299 aa  131  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.68 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.86 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  28.07 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1196  hypothetical protein  27.84 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265897 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  26.36 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.9 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.23 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  25 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  25.49 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.79 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.38 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.24 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  21.59 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  26.14 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.11 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  29.02 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.87 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.1 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  27.81 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  24.76 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  26.46 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  26.06 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  26.74 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  25 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  23.4 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.44 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  29.11 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  24.27 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  25.68 
 
 		 235 aa  52.4  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  24.41 
 
 		 325 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  21.65 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  21.65 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  21.65 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  25.12 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  24.62 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.79 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  25.29 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.98 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  26.32 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  21.86 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  25.47 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  24.79 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  23.3 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  27.01 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.32 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.01 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  24.22 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  27.97 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  26.85 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  24.69 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  27.4 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  27.01 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  20.35 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  20.35 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  20.35 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  20.35 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  20.35 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  20.35 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  20.35 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  20.35 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  20.35 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  24.66 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  26.01 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  22.48 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  23.7 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.91 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.91 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.91 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.91 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  22.1 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.91 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  30.22 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  22.62 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.51 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.02 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  28.33 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1371  competence lipoprotein ComL  25.13 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  23.35 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.48 
 
 		 245 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  23.35 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0923  putative competence protein ComL  22.12 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  23.35 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  23.35 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  21.4 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  27.73 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  21.05 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  22.81 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  25.47 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  20.64 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>